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Taller: “Desarrollo ágil de aplicaciones científicas”

Por • Fecha 11 Oct, 2016 • Con 0 Comentarios

Durante esta presentación, se revisarán mecanismos alternativos de paralelización (OpenACC) usando aceleradores de cálculo numérico del tipo GPU.

La dificultad de programar códigos para estas tecnologías, ha sido un punto sensible para la mayoría de los investigadores que desean migrar sus ideas a estas arquitecturas, que hoy representan una potente alternativa de bajo costo en el mundo del HPC. En este sentido el esfuerzo de standards como OpenMP y OpenACC han facilitado el acceso a muchas comunidades científicas para explotar hardware de cálculo intensivo de última generación. En esta plática, se abordará un panorama general de como funciona el standard de OpenACC y como implementar las directivas del mismo. Finalmente, se presentará una herramienta de predicción de proteínas (modelo HP) acelerada con OpenACC, la cual es desarrollada por el grupo de I+D dentro de Lufac® Computación.


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CICESE, ensenada, Baja California Norte.

Por • Fecha 07 Oct, 2016 • Con 0 Comentarios

La Dirección de Telemática del CICESE, en conjunto con la Red Mexicana de Supercómputo, les extiende una cordial invitación a participar en el "HPC+BigData Technologies Workshop" que se llevará a cabo del 27 al 30 de Septiembre del 2016 en el Auditorio Institucional, como parte de las actividades para la celebración del 43 Aniversario del CICESE.

El objetivo del taller es dar a conocer a los asistentes la innovación tecnológica en ciertas áreas del supercómputo y manejo de grandes volúmenes de datos con la finalidad de compartir experiencias con expecialistas en el área de análisis y compilación de modelos numéricos, cómputo de GPUs y manejo de datos científicos.

Como instructores del taller se tendrá la participación de especialistas de Intel (EUA), Mellanox, Supermicro, LUFAC Computación y APC Schneider Electric.


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GPU-accelerated molecular dynamics simulations for systems with Lennard-Jones type potentials

Por • Fecha 18 May, 2016 • Con 0 Comentarios • En: Nvidia |

In this work a basic algorithm to study molecular systems with Lennard-Jones type potentials is presented. A parallelization strategy with CUDA is implemented in order to accelerate the computations using GPU. Simulation results with a large number of particles (about 106) show different equilibrium states that depend on the initial arrangement (fcc-crystal or random) of particles. This is due to the difference in total energy depending on the initial configuration. These differences are accentuated when the number of particles are greater than 105. For small systems (<100,000 atoms) differences in total energy for systems with different configurations are negligible, and the systems exhibit the same equilibrium states. As such phenomena appear only in large systems, hence the urgent need of parallelization strategies using GPU's. 


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Avances y proyecciones GTC-2016

Por • Fecha 02 May, 2016 • Con 0 Comentarios • En: Nvidia |

Se listan brevemente las modificaciones en las familias de GPUs para el año 2016 por parte de la compañía Nvidia®. También se presentan las nuevas tecnologías: la tarjeta P100, Nvlink®, memorias HBM2® y los nuevos modelos de programación para la arquitectura Pascal. Finalmente, se muestran la directrices para el año 2016 en el Área de I+D en Lufac®, las cuales se concentran en el desarrollo de Aplicaciones Científicas usando OpenACC y las herramientas de depuración y caracterización más modernas (Allinea).


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Pruebas de rendimiento y precisión entre GPUs Nvidia de Gama Alta (Tesla K80) y tarjetas de Gama Media (GeForce)

Por Jose Zamora • Fecha 04 Sep, 2015 • Con 0 Comentarios • En: Nvidia |

Resumen— Las pruebas de rendimiento y precisión mostradas de en este trabajo se realizaron explorando las mejoras de tarjetas GPU Nvidia en su serie de HPC denominadas Tesla. Las comparativas se realizaron con tarjetas de Gama Media (GeForce) creadas en un principio para entusiastas de los videojuegos. El software de prueba  es Hoomd, Lammps y Moldynamics en sus versiones más nuevas. En un futuro se agregarán más programas de prueba.


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