image
image

Estados finales en diferentes tamaños de sistemas moleculares

Por Jose Zamora • Fecha 01 Sep, 2015 • Con 0 Comentarios • En: Sistemas | Simulaciones |

Resumen— Describir el estado del arte del siguiente problema científico: “En simulaciones de 1 millón de partículas se llegan a estados finales distintos a partir de estados iniciales diferentes, en sistemas menores a 500,000 partículas los estados finales son idénticos.” Este problema está bien definido, se puede describir a corto plazo y se requiere un sistema computacional con la potencia numérica suficiente como para simular problemas pequeños (~10e3 elementos) y problemas enormes (~1e6 elementos).


image

Polimorfismo y Simulación Computacional

Por Jose Zamora • Fecha 04 Dec, 2014 • Con 0 Comentarios

Resumen—Considerar perfeccionar las técnicas de programación para aplicaciones de cómputo científico, puede ser fundamental para que que se alcancen los rendimientos más óptimos en simulaciones numéricas. Existen factores adema ́s del rendimiento que se deben tomar en cuenta cuando se construyen programas científicos, en este trabajo se abordan tres ramas importantes: que los códigos sean rehusables, ordenados y empaquetados. El paradigma de programación usado para cubrir estos requerimientos es la Programación Orientada a Objetos (POO). Al final de este trabajo se reportan rendimientos para diferentes implementaciones de polimorfismo usando el lenguaje de programación C++, en la solución al problema numérico de N-cuerpos.


image

GPU’s molecular dynamics simulation of a one million particles

Por Jose Zamora • Fecha 03 Dec, 2014 • Con 0 Comentarios


AbstractIn this work the main algorithms involved in a molecular dynamics simulation are described. We present an strategy of parallelization using CUDA to accelerate the computations in GPUs. We show several examples of application of our implementations for 500, 2048, 10000 and 106 particles. We show very good results in terms of computation time and accuracy of the results.



LUFAC - Soluciones en Supercomputo Conocenos

Web Services: Zian Fanti